熱解析操作參數主要是解析溫度、解析時間、載氣流量等：

解析溫度要求嚴格控制升溫速率和最終溫度。升溫速率越快、最終溫度越高，解析速度越快，進人色譜柱的初始樣品譜帶越窄。溫度上限受樣品或吸附劑熱穩定性的限制。熱解析溫度過低，可能會使樣品中的待測組分解析不完全，回收率低，管中殘留量大；熱解析溫度太高，可能會使某些待測組分對熱不穩定而導致回收率低。一般常用的解析溫度在300℃以下。

解析時間主要取決于待測物與樣品基質作用的大小，以及樣品顆粒的大小。解析過程往往是較慢的，需要較長的時間。太長的解析時間會導致初始譜帶寬度加寬，不利于分離。為了解決這個問題，一般采用冷凍聚焦等技術來提高分離效率。